All modules for which code is available

• demuxEM.tools.demuxEM
• pegasus.annotate_cluster.annotate_cluster
• pegasus.misc.misc
• pegasus.plotting.plot_library
• pegasus.pseudo.convenient
• pegasus.tools.batch_correction
• pegasus.tools.clustering
• pegasus.tools.diff_expr
• pegasus.tools.diffusion_map
• pegasus.tools.doublet_detection
• pegasus.tools.gradient_boosting
• pegasus.tools.gsea
• pegasus.tools.hvf_selection
• pegasus.tools.nearest_neighbors
• pegasus.tools.nmf
• pegasus.tools.preprocessing
• pegasus.tools.pseudobulk
• pegasus.tools.pseudotime
• pegasus.tools.scvitools
• pegasus.tools.signature_score
• pegasus.tools.visualization
• pegasusio.data_aggregation
• pegasusio.readwrite