All modules for which code is available

• pegasus.annotate_cluster.annotate_cluster
• pegasus.demuxEM.demuxEM
• pegasus.io.io
• pegasus.misc.misc
• pegasus.tools.batch_correction
• pegasus.tools.clustering
• pegasus.tools.data_aggregation
• pegasus.tools.diff_expr
• pegasus.tools.diffusion_map
• pegasus.tools.gradient_boosting
• pegasus.tools.hvf_selection
• pegasus.tools.nearest_neighbors
• pegasus.tools.preprocessing
• pegasus.tools.pseudotime
• pegasus.tools.signature_score
• pegasus.tools.visualization
• scplot.plot